常見問題如下：

1.水族箱的高度。近幾年受大型魚風氣的影響，大型水族箱在一般家庭中經常出現。而這種水族箱往往高度過高。在日後清潔箱壁和修剪水草帶來相當難度。而最理想的水族箱高度是最高不超過兩尺半約75公分。

2.照明系統經常出現問題。因為水族箱中常養殖水草，需要一定的光照，箱體采用照明系統且長時間開啟，內部鎮流器就有可能出現過熱損壞，甚至有火災隱患。如果器具防觸電保護設計不佳，則存在觸電危險。

3.內置其他維生系統，包括恒溫器、過濾器等，因為這些設備都必須是全天候開啟，故障率也尤其高，市面上大部分水族箱沒有設置故障報警燈，所以內部設備出現故障的時候也無法察覺，只能靠觀察魚的表現以及每日檢查來預防，比較繁瑣。一般情況下恒溫器和過濾器只要其一產生故障沒有及時發現，往往會造成整個水族箱中生物群體死亡，帶來損失。